南科以產業創新致力於開創園區產業動能，2020年全年營業額達8,477.31億元，較2019年增加14.06%，主因為積體電路產業因擁有先進製程技術，具備國際競爭力，其營業額5,465.87億元為最大宗，且受惠全球半導體供不應求，以及全球最先進之5奈米製程逐步在南科量產之成長趨勢，營收成長達20.71%；光電產業營業額2,122.76億元居次， 2020年初時雖受全球疫情衝擊出貨遞延之影響，導致營收衰退；而後續宅經濟所帶來之爆發性成長，帶動面板報價走揚，受惠此波反轉成長趨勢，全年營收成長為0.09%。通訊、電腦及周邊產業則因台商回流紅利，營收成長分別為39.33%、37.66%；此外，南科長期投入發展之生技產業營收成長為37.05%。
園區出口部分，南科2020年六大產業，以積體電路產業出口額2,795.25億元占最大宗，占南科出口比重達54.90%，出口額較2019年成長38.80%，係受惠5G、高效能運算與物聯網等市場之強勁需求；出口比重居次者為光電產業，2020年出口額為1,733.43億元，占南科出口額比重約34.04%，出口額較2019年同期微幅下滑0.92%，主因係2020年初時受全球疫情蔓延影響生產動能，致出口額減少。
南科2020年共引進22家廠商，投增資額達2,788億元，近期亮點廠商投資情形如下：
(1) 穩懋半導體股份有限公司南科分公司：穩懋公司看好無線通訊規格提升到5G及Wi-Fi 6/7之手持式裝置及基地台等基礎建設之需求，預計總投資金額將超過新台幣850億元，持續擴充產能服務全球客戶，未來將創造超過4,000名就業機會，強化南科整體產業競爭力。
(2) 台灣積體電路製造股份有限公司：台積電公司舉辦「三奈米廠新建工程上樑典禮」，預計將在南科投入超過新台幣 2 兆元，未來當三奈米新廠落成並進入量產，將會有約 2 萬名台積電員工在南科工作與生活，帶動南科更加蓬勃發展，並持續壯大南科半導體產業聚落。
(3) 特銓股份有限公司：特銓公司為一家專業智能檢測及自動化設備製造商，投資台南園區新台幣1億元，生產光學檢測設備及輔助系統，為國內少數有能力製造半導體前段製程設備之廠商，客戶涵蓋國內外半導體大廠。
南科營業額成長，園區從業人員功不可沒，為推動園區事業職場平權，提升職場友善工作環境，讓員工與事業單位共榮共好， 2020年表揚66名園區優良從業人員及9家推動職場平權事業單位；另於台南及高雄舉辦就業博覽會協助民眾就業、廠商徵才，以客製化服務整合公私部門資源，2020年吸引逾3,200人參加實體及線上徵才活動。
園區環境友善方面，南科管理局辦理之「沙崙智慧綠能科技聯合研究中心」以創能、節能、儲能及智慧整合，並兼顧生態多樣性的特色脫穎而出，榮獲第一級建築工程類「優等」殊榮，同時也為『三鑽石』建築(綠建築、智慧建築、碳足跡認證)，在創能儲能方面，亦獲得「2020城市工程品質金質獎-太陽光電類金質獎」。本案於屋頂上設置容量達 668 峰瓩太陽能發電系統，年減碳效益相當於一座大安森林公園整年之減碳排量。綠能聯合科技研究中心完工後將成為智慧綠能指標建築，並為台灣聚焦前瞻綠能技術研究及智慧決策中心。
展望2021年，由於積體電路最先進之5奈米製程逐步放量，以及光電產業受惠宅經濟所帶來之成長趨勢，預估南科營業額將可持續成長，並配合「臺灣2030—創新、包容、永續」願景，持續推動暨有園區創新轉型，並推動橋頭園區、台南園區三期擴建及嘉義園區與屏東園區朝精緻多元、優生活、低耗能之新型態園區發展。