支持進行快速的接近樣本冠狀病毒測序,從而對疫情爆發進行監測

英格蘭牛津2020年2月3日 /美通社/ -- 在獲得中國公共健康專業人員的廣泛支持並與他們進行合作之後,Oxford Nanopore已經向中國發運了另外200台MinION測序儀以及相關耗材。這些器械將被用於對現在的冠狀病毒爆發進行持續監測,為已經在中國安裝的設備帶來大批支援力量。

700Kg of Oxford Nanopore sequencers and consumables are on their way for use by Chinese scientists in understanding the current coronavirus outbreak.
700Kg of Oxford Nanopore sequencers and consumables are on their way for use by Chinese scientists in understanding the current coronavirus outbreak.

 

MinION is the only portable, real-time device for DNA and RNA sequencing.
MinION is the only portable, real-time device for DNA and RNA sequencing.

 

Each MinION sequencer is approximately the size of a stapler, and can provide rapid sequence information about the coronavirus.
Each MinION sequencer is approximately the size of a stapler, and can provide rapid sequence information about the coronavirus.

 

Oxford Nanopore已經為100多個中國公共衛生實驗室,以及一系列中國微生物學實驗室和全球公共衛生科學家提供支持,越來越多的科學家開始參與監測過程。

Oxford Nanopore行政總裁Gordon Sanghera博士表示:「我們很榮幸能夠與全球科學界合作,支持他們了解此次疫情爆發的問題。我們希望納米孔能使任何人能夠在任何地方獲取生物信息,并能夠產生積極的影響,並且非常感謝科學界在我們努力為此次疫情爆發迅速優化時,給予我們支持。

MinION測序儀被設計用來進行廣泛使用。這款測序儀重量不超過100克,搭配便攜式/特別配件MinIT,以便進行數據分析。MinION測序儀能夠實時簡化序列數據,支持進行快速測序,非常適合在分散開來的地點開展快速測序工作。之前,這款設備已經在鄉村/偏遠地區背景下,進行過測序,例如支持對伊波拉病毒、寨卡病毒或結核杆菌的了解。

伯明翰大學(University of Birmingham)的Josh Quick於2016年在自然(Nature)雜志上表示:「我們能夠在獲得埃博拉病毒陽性樣本24小時以內取得結果,測序過程僅需15分鐘至60分鐘。我們能夠證明,在資源有限的背景下,進行實時基因組監測是可行的,這樣的監測能夠迅速展開,支持監測疫情。(請參閱:https://www.nature.com/articles/nature16996

冠狀病毒的快速排序,一直都是了解疫情爆發問題上面的一項必要工具。序列信息一般能夠將地點和時間數據結合到一起,就病毒如何傳播和是否發生變異,進行洞察分析。

Oxford Nanopore的測序技術,已經被用於來自於中國的眾多早期冠狀病毒基因組的測序,包括在《新英格蘭醫學期刊》(NEJM)上公佈的首個基因組,在《柳葉刀》(Lancet)雜志上發佈的表明人際間傳播的家族「聚集性」肺炎的基因組,以及美國發佈的首個新型冠狀病毒基因組。

科學界的研究者已經為新型冠狀病毒(nCoV)的納米孔測序,開發了專門方案;Oxford Nanopore正在與科學界一起對這些方案進行優化。

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